چون دوره بعثمان رسید که او هم بحکم شمشیر شورای شش نفری که اکثریت آن باز در دست امویان بوده بر اریکه خلافت تکیه زد حکومت عربی خاصی متمایل باموی تشکیل داد و موضوع انتخاب و ولایتعهدی از بین رفت بلکه بصورت توطئه شورای حزبی بضرب الاجل شمشیر برگزار و انتخاب شد و امویان در آراء عثمان تأثیر بسزا یافتند و تحولاتی ریشهدار بوجود آوردند و عثمان که عزم راسخ نداشت ناسخ و منسوخ بسیار برای فرمانروایان طرفداران اموی صادر میکرد که بدین جرم کشته شد و فقط کار مثبتی که انجام شد بالضروره انجمنی از کتاب وحی تشکیل دادند و پس از تبادل افکار ناگزیر همانها که میگفتند ما بقرآن علی احتیاج نداریم ناچار شدند علی بن ابیطالب (علیه السلام) را رئیس آن انجمن نمایند و قرآنها را با قرآن علی بن ابیطالب تطبیق دهند و تنظیم کنند و همه اوراق قرآنهای متفرقه را جمع نمایند و فقط قرآنی که بامضاء علی (علیه السلام) رسیده و او کاتب وحی بود بنحوی که سایه صفت از پیغمبر خدا و نزول وحی غفلت و جدائی نداشت قرآن را تنظیم نمودند و شش قرآن از روی آن نوشتند و بشرحی که در آخر قرآنهای چاپ مصر است تمام مسلمین را موظف نمودند از آن تبعیت نمایند. بمقدمه ترجمه و تفسیر قرآن نگارنده مراجعه شود
در این عصر هم فرصتی کامل برای نشر احکام دست نداد و تحولات فکری و اندیشه جمع مال و صرف در راه حزبی و فعالیتهای سیاسی میدان بدرس و بحث قرآن و نشر احکام نمیداد.